盡管各國的相關標準、規范，對空調系統二次污染均給予了高度重視，但是提出的對策并不完善。只有依據《醫院潔凈手術部建設標準》和《醫院潔凈手術部建筑技術規范》的技術思路，開發新型空調機組和系統，實施全新的凈化除菌概念，用綜合性措施進行全面控制，才能*、有效地解決空調二次污染問題。
醫院內的細菌控制與交叉感染控制，一直是醫院工作重點，也是醫院空調的主要任務。但是，與人們的初衷相反，許多醫院的空調系統，由于各種原因，往往成為院內感染（Hospital acquired infection）的主要根源之一。
空調系統造成院內感染的途徑有多種，例如，有因空調機組本身的問題，或系統設計、安裝的問題，而引起的院內感染（被稱為“不合適空調”）；也有因空調的運行、管理問題，而引起院內感染的現象。醫院空調的制造者、系統的設計者，理應更為全面、更為妥善地解決這些問題。醫用空調機組及其系統有效的細菌控制，是我們面臨的緊迫任務。